تیپ بندی مولکولی سویه های اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک(UPEC) در استان اصفهان و دسته‌بندی ژنتیکی جدایه‌های سروگروپ O25 به روش ERIC-PCR

فصلنامه بیولوژی کاربردی

مقاله 4، دوره 9، شماره 33، خرداد 1398، صفحه 31-42   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

حسن ممتاز^{* 1}؛ فاطمه رییسی²؛ زهرا بم زاده³

¹استاد میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران

²دانش آموخته ارشد میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران

³گروه میکروبیولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران

چکیده

سابقه و هدف: اشریشیاکلی شامل طیف گسترده ای از سویه های مختلف در اکوسیستم ها با تنوع زیاد در ژنوم آنها است. برخی از انواع سویه ها باعث ایجاد بیماری های جدی مانند عفونت های دستگاه ادراری (UTI) می گردند. اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک (UPEC) شایع ترین عامل ایجاد عفونت ادراری در انسان است. هدف از این مطالعه بررسی شیوع انواع سروگروپ های O در جدایه های اشریشیاکلی جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت ادراری در استان اصفهان و دسته‌بندی ژنتیکی جدایه‌های سروگروپ O25، به روش ERIC-PCR می باشد.
مواد و روش کار: 226 نمونه ادرار از بیماران مبتلا به عفونت ادراری در بیمارستان های استان اصفهان جمع آوری و مورد بررسی قرار گرفتند. جدایه های اشریشیاکلی با استفاده از روش های بیوشیمیایی شناسایی شدند. سروگروپ های این جدایه ها به روش PCR تعیین و دسته بندی ژنتیکی جدایه های دارای سروگروپ O25 با استفاده از روش ERIC-PCR انجام گرفت.
نتایج: از میان کل نمونه های مورد مطالعه، 96 جدایه اشریشیاکلی جدا گردید. شایع ترین انواع سروگروپ O، O25(5/37 درصد)، O21(37/9 درصد) و O6(33/8 درصد) بودند. دسته بندی ژنتیکی جدایه های دارای سروگروپ O25، 25 پروفایل مختلف را در میان این 36 جدایه نشان داد.
نتیجه گیری: تکنیک ERIC-PCR روش سریع، حساس و ارزان قیمت می باشد. وجود تنوع ژنتیکی در جدایه ها نشانگر منابع مختلف آلوده کننده دستگاه ادراری به این باکتری است و این روش یک تکنیک مناسب جهت تایپینگ مولکولی سویه های اشریشیاکلی جدا شده از منابع مختلف عفونت های مجاری ادراری می باشد.

کلیدواژه‌ها

ERIC-PCR؛ عفونت دستگاه ادراری؛ آنتی ژن O؛ اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک

مراجع