شناسایی تنوع زیستی نوکاردیا های جدا شده از نمونه های بالینی بیمارستان های تهران با روش فنوتیپی و روش مولکولی

فصلنامه بیولوژی کاربردی

مقاله 4، دوره 9، شماره 34، شهریور 1398، صفحه 40-52   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

فاطمه قره باغی^{* 1}؛ سید سعید اشراقی²؛ سید ذاکر بستان آباد³

¹زیست شناسی،ژنتیک،دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران مرکزی،تهران،ایران

²گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران،تهران،ایران

³گروه میکروب شناسی و بیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد پرند،تهران ،ایران

چکیده

زمینه و هدف: نوکاردیا یک باکتری گرم مثبت، رشته ای با ویژگی اسید فست نسبی است . نوکاردیوزیس معمولا به شکل بیماری حاد یا مزمن همراه با چرک یا ایجادگرانولوماتوز نمایان می شود که می تواند بیماری مهاجمی را هم در افراد سالم وهم در افراد ایمونوساپرس ایجاد کند. هدف از این مطالعه شناسایی تنوع زیستی نوکاردیا های جدا شده از بیمارستان های تهران با روش فنوتیپی و مولکولی PCR است.
روش بررسی: تعداد 200 نمونه بالینی از محوطه بیمارستانهای تهران جمع آوری شد. پس از انجام جداسازی توسط روش Paraffin baiting کلونی ها با بررسی ماکروسکوپی و سپس میکروسکوپی توسط رنگ آمیزی گرم و اسید فست نسبی، توانایی رشد در لیزوزیم مایع، رشد در 45 درجه سانتیگراد و سایر تست های بیوشیمیایی مورد ارزیابی قرار گرفت. در نهایت با طراحی پرایمر اختصاصی جنس و انجام واکنش PCRبه مقایسه دو نتیجه با یکدیگر پرداخته شد.
یافته ها: از تعداد 200 نمونه ، 30 ایزوله بدست آمد که از نظر کشت و تست های بیوشیمیایی مثبت تشخیص داده شد .
نتیجه گیری: با توجه به تنوع گونه های مختلف جنس نوکاردیا به دلیل شرایط متفاوت در انجام تست های فنوتیپی و بیوشیمیایی ممکن است جنسی دیگر از خانواده اکتینومیست به اشتباه نوکاردیا تشخیص داده شود و انجام روش های مولکولی می تواند تاییدی بر روش فنوتیپی باشد .

کلیدواژه‌ها

نوکاردیا؛ بیمارستان های تهران؛ نمونه بالینی؛ شناسایی فنوتیپی؛ شناسایی مولکولی

مراجع