بررسی تنوع ژنتیکی یک جمعیت از گوسفندان زندی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

پژوهش های بالینی و آزمایشگاهی دامپزشکی

دوره 4، شماره 11، تیر 1389، صفحه 79-86   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

چکیده

در مطالعه حاضر تنوع ژنتیکی در گوسفندان زندی با استفاده از پانزده مارکر ریزماهواره بررسی گردید. DNA ژنومی از تعداد 120 نمونه خون به روش استخراج نمکی بهینه شده، بدست آمد. همه 15 جایگاه با موفقیت تکثیر شدند و همه جایگاه‎ها چند شکلی داشتند. آزمون فراوانی ژنوتیپ‎ها برای انحراف از تعادل هاردی – وینبرگ(HWE)  در هر لوکوس انجام گردید که بخاطر فزونی هتروزیگوت‎ها در همه جایگاه‎ها انحراف از تعادل مشاهده شد (P<0.001). پارامتر‎های تنوع از قبیل تعداد آللها و تنوع ژنی (هتروزایگوسیتی)، سطح بالائی از مقدار تنوع را بوسیله نشانگر‎های ریز‎ماهواره آشکار نمود. در این مطالعه همچنین ملاک‎های دیگر تنوع ژنتیکی شامل ارزش‎های PIC و شاخص شانن محاسبه شدند. میانگینمحتوایاطلاعات چندشکلیدرجمعیتبه ازای تمام جایگاه‎ها، برابر 808/0 بود که نشان از تغییر‎پذیری بسیار بالا در جمعیت مورد مطالعه می‎باشد. میانگینشاخصاطلاعاتشانون نیز در جمعیت مورد مطالعه بالا بود (09/0 ± 92/1 .(نتایج پارامتر‎های تنوع نشان داد که تنوع ژنتیکی در نژاد زندی بالا می‎باشد. همچنین این تحقیق نشان داد که مارکر‎های ریز‎ماهواره ابزاری سودمند برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در حیوانات اهلی است.

کلیدواژه‌ها

گوسفند زندی؛ نشانگر‎های ریزماهواره؛ تنوع ژنتیکی؛ تعادل هاردی ـ وینبرگ

مراجع

1-     بنابازی، م. (1381): بررسی تنوع ژنتیکی در درون و بین پنج جمعیت گوسفند ایرانی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره. پایان نامه کارشناسی ارشد علوم دامی. دانشکده کشاورزی. دانشگاه تهران. 130ص.

2-     توکلیان، ج. (۱۳۷۸) : نگرشی بر ذخائر ژنتیکی دام و طیور ایران. انتشارات موسسه تحقیقات علوم دامی کشور.

3-     زاهدی، ز. (1383): بررسی چند شکلی تعدادی از نشانگرهای ریزماهواره در گوسفند بلوچی. پایان نامه کارشناسی ارشد علوم دامی. دانشکده کشاورزی. دانشگاه تربیت مدرس. 89 ص.

4-      ننه‎کرانی، ش. (1389): بررسی تنوع ژنتیکی گوسفندان نژاد پوستی ایران با استفاده از برخی نشانگرهای مولکولی ریز‎ماهواره. رساله دکتری تخصصی علوم دامی، ژنتیک و اصلاح نژاد دام. دانشکده کشاورزی. دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران. 154 ص.

5-      Arora, R., Bhatia, S., Sehrawat, A., Maity, S. B. and Kundu, S. S. (2008): Genetic variability in Jalauni sheep of India inferred from microsatellite data. National Bureau of Animal Genetic Resources, P.O.Box129, Karnal-132001, Haryana, India.

 

 

 

6-      Arora, R., Lakhchaura, B. D., Prasad, R. B. and Tantia, M. S. (2004): Genetic diversity analysis of two buffalo populations of northern India using microsatellite markers. Journal of Animal Breeding and Genetics. 121: 111-118.

7-      Arranz, J. J., Bayon, Y. and San Primitivo, F. (2001): Differentiation among Spanish sheep breeds using microsatellites. Genetic Selection and Evolution 33, 529-542.

8-      Botstein, D., White, R. L., Skolnick, M. and Davis, R. W. (1980): Construction ofa genetic map in man using restriction fragment length polymorphisms. Amer. Journal of Human Genetic. 32: 314–331.

9-      Buchanan F.C. and Thue T. D. (1998): Intra breed polymorphic information content of microsatellites in cattle and sheep. Canadian Journal of Animal Science 78, 425-428.

10-  Cornuet, J. M., Piry, S., Luikart, G., Estoup, A. and Solignac, M. (1999): New methods employing multi locus genotypes to select or exclude populations as origins of individuals. Genetics 153, 989-2000.

11-  Diez-Tascon, C., Littlejohn, R. P., Almeida, P. A. R. and Crawford, A. M. (2000):Genetic variation within the merino sheep breed: analysis of closely related populations using microsatellites. Animal Genetics 31, 243-251.

12-  Farid, A., O`Reilly, E., Dollard, C. and Kelsey. Jr. C. R. (2000): Genetic analysis of ten sheep breeds using microsatellite markers. Canadian Journal of Animal Science 80, 9-17.

13-  Hedrick, P. W. (1999): Genetic of populations, Second edition. Jones and Bartlett Publishers, Sudbury, MA, USA.

14-  Hedrick, P. W. (2000): Genetic of populations. Second edition. Jones and Bartlett Publishers, Sudbury, MA, USA. Pp 553. ISBN 0 7637 10768. DOI:10.1046/j.1365-2540.2000.0819a.x

15-  Maddox, J. F., Riffkin, C. D. and Beh, K. J. (2000): Dinucleotide repeat polymorphism at the ovine McMA1, McMA2, McMA5, McMA8, McMA9, McMA11, McMA14, McMA20, McMA24, McMA26 loci. Animal Genetics 31, 148-149.

16-  Media Cybernetics Inc. (1998): GEL-Pro Analyzer software. Version 3.1. Silver Spring MD. USA.

17-  Miller, S. A., Dykes, D. D. and Polesky, H. F. (1988): A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research 16, 1215.

18-  Monem, M., Kiyanzad, M. R. and Gharahdagi, A. A. (2006): (Small ruminant breeds of iran) of book Characterization of small ruminant breeds in west asia and north Africa, 3^th edition Pp 18-36

19-  Ott, J. (1989): Program HET Version 1.10 . Utility programs for analysis of genetic linkage. Rockefeller University. New York, NY, USA. ftp://linkage.rockefeller.edu/software/utilities/.

20-  Peakall, R. and Smouse, P. E. (2006): GENALEX 6: genetic analysis in Excel.Population genetic software for teaching and research. Mol Ecol Notes. 6:288-295.

21-  Vanhooft, W. F., Hanotte, O., Wenink, P. W., Groen, A. F., Sugimoto, Y. H., Prins, H. T. and Teale, A. (1999): Applicability of Bovine Microsatellite Markers for Population Genetic Studies on African Buffalo (Syncerus caffer). Anim. Genet. 30: 214-220.

22-  Yeh, F. C., Yang, R. and Boyle, T. (1999): POPGENE. Version 1.31. Microsoft Window–based Freeware for Population Genetic Analysis, University of Alberta. Edmonton, AB, Canada