آنالیزفیلوژنتیکی جمعیتی از گوسفند افشاری با استفاده از توالی HVR-IوcytB میتوکندریDNA

دانش زیستی ایران

دوره 17، شماره 1، خرداد 1401، صفحه 1-8   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.30495/zisti.2022.1964418.1130

نویسنده

کیان پهلوان افشاری^*

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین-پیشوا، ورامین، ایران

چکیده

سابقه و هدف: در بین نشانگرهای ژنتیکی، توالی‏یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روش‏ها برای طبقه‏بندی ژنتیکی جمعیت‏ها و گونه‏ های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه‏ های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه‏ ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی می‏باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه HVR1 و CytB از ژنوم میتوکندری گوسفند افشاری می‏باشد.
مواد و روشها: برای انجام این تحقیق تعداد 40 نمونه خون از هر دو جنس از گوسفندان غیر خویشاوند افشاری جمع‏آوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه HVR1 و CytB توسط پرایمرهای اختصاصی تکثیر شده و تعیین توالی شدند. توالی‌های به‌دست آمده با استفاده از برنامه Chromas Lite 2.01 تجزیه و تحلیل شد. جهت تعیین بالاترین همولوژی توالی گوسفند افشاری از رویه Blast تحت پایگاه NCBI استفاده شد.
یافته ها: پس از تعیین توالی، با مقایسه توالی CytB و HVR1 از ژنوم گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژادها از مناطق مختلف جهان به ترتیب 3 هاپلوتیپ و 5 هاپلوتیپ مشاهده شد. علاوه بر این هر دو مقر دارای چندشکلی بالایی بودند.
نتیجه گیری: تعیین توالی ژنوم میتوکندری به خوبی می تواند تنوع ژنتیکی و ارتباط خویشاوندی گونه های مختلف گوسفندان را نشان دهد. لذا ابزار قدرتمندی است که می تواند برای بررسی تنوع ژنتیکی سایر نژادهای گوسفندی مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه‌ها

DNAمیتوکندری؛ ناحیه HVR1 و CytB؛ تعیین توالی؛ فیلوژنی؛ گوسفند افشاری

مراجع