پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 418 |
| تعداد شماره‌ها | 10,006 |
| تعداد مقالات | 83,645 |
| تعداد مشاهده مقاله | 78,613,260 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 55,767,952 |
بررسی توالی‌های نوکلئوتیدی و اسید‌آمینه‌ای آنزیم اِنهانسین در باکولوویروس‌ها | ||
| فصلنامه علمی پژوهشی دنیای میکروب ها | ||
| مقاله 3، دوره 16، شماره3(پیاپی 55) - شماره پیاپی 56، آذر 1402 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.30495/jmw.2023.1981569.2055 | ||
| نویسندگان | ||
| مریم راشکی* 1؛ مجتبی مرتضوی2 | ||
| 1تنوع زیستی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان | ||
| 2گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، | ||
| چکیده | ||
| سابقه و هدف: یکی از گروه‌های ژنی مهم که در برخی از باکولوویروس‌های بیمارگر حشرات حفاظت‌شده‌اند، ژن‌های ̗انهانسین هستند. در تحقیق حاضر، توالی‌های نوکلئوتیدی و پروتئینی انهانسین و روابط فیلوژنتیک میان آن‌ها همراه با تجزیه‌و‌تحلیل کدونی توالی‌های نوکلئوتیدی و نواحی حفاظت‌شده با استفاده از پایگاه‌های محاسباتی بررسی‌شد. مواد و روش‌ها: توالی های نوکلئوتیدی و اسید‌آمینه‌ای مربوط به ژن ̗انهانسین از بانک‌ژن استخراج و برای رسم درخت فیلوژنتیکی بر مبنای روش حداکثر احتمال استفاده‌شد. توالی‌های نوکلئوتیدی مربوط به نه ژن منتخب برای بررسی فراوانی کدون‌ها انتخاب و از پایگاه سکوئنس مانیپیولیشن سوئیت استخراج‌شدند. برای مشاهدة نواحی حفاظت‌شده در توالی‌های اسید‌آمینه‌ای از سایت موتیف‌سرچ استفاده شد. یافته‌ها: درخت رسم‌شده بر اساس توالی‌های نوکلئوتیدی و اسید‌آمینه‌ای، به ترتیب دو و سه گروه اصلی را به نمایش‌گذاشت. توالی‌های آگروتیسسگتومگرانولوویروس، اپروفترابروماتانوکلئو‌پلی‌هدرو‌ویروس و کوریستونورافومیفرانامالتیپلنوکلئو‌پلی‌هدرو‌ویروس هر کدام در گروه مجزای خود قرار‌داشتند. در تمام نه توالی نوکلئوتیدی منتخب، کدون‌های فراوان‌تر شامل ATG و TGG بودند که به ترتیب با اسید‌‌آمینه‌های متیونین و تریپتوفان ارتباط داشتند. در توالی‌های اسید آمینه‌ای، توالی حفاظت‌شدة HEXXH مشخص‌شد. توالی‌های حفاظت نشدة متناظر HAISF، HCMAE، QTLGD، HQXXH و HVXXH در برخی مشاهده‌شدند. نتیجه‌گیری: از آنجا که تولید و ترشح هر چه بیشتر آنزیم انهنسین می‌تواند برای افزایش فعالیت حشره کشی باکولوویروس‌ها استفاده شوند و بصورت تجاری برای کنترل آفات بکار‌روند، مطالعات بیوانفورماتیک برای پیش‌بینی ویژگی‌های نوکلئوتیدی و اسید‌آمینه‌ای پروتئین‌های مذکور در این زمینه بویژه با تولید باکولوویروس‌های نو‌ترکیب می‌تواند بسیار راه‌گشا‌باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| اِنهانسین؛ باکولوویروس؛ پردة دور غذا؛ کدون؛ نرم‌افزار | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 97 |
||