تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از بز نجدی با استفاده از توالی HVR1 ژنوم میتوکندری

فصلنامه زیست شناسی جانوری

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 15 دی 1402

نوع مقاله: مقالات پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/ascij.2023.1999044.1550

نویسندگان

روح الله خادمی¹؛ سیده ام البنین قاسمیان^{* 2}؛ حمید رضا سیدآبادی³؛ امین کاظمی زاده⁴

¹گروه علوم دامی، واحد بهبهان، دانشگاه آزاد اسلامی، بهبهان، ایران.

²گروه دامپزشکی، واحد بهبهان، دانشگاه آزاد اسلامی، بهبهان، ایران

³موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.

⁴بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان لرستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، خرم آباد، ایران

چکیده

این مطالعه با هدف تعیین توالی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری بز نجدی انجام گرفت. برای انجام این تحقیق تعداد 30 عدد نمونه خون از هر دو جنس از بزهای غیر خویشاوند جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR تکثیر شد و تعیین توالی شد. برای مقایسه‎، فیلوژنی توالی ناحیه HVR1 بدست آمده از بز نجدی با سایر نژادها در جهان برای تعیین گروه هاپلوتیپی رسم گردید. درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده برای نمونه‎ها نشان داد که همگی از یک جمعیت منشأ گرفته‎اند و تعداد 5 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 20 نوکلئوتید چند شکل (SNP) برای ناحیه HVR1 موجود در توالی‎ها تعیین گردید. همچنین توالی ناحیه HVR1 نمونه مورد بررسی با 11 توالی ثبت شده از 6 گروه هاپلوتیپی از کشورهای مختلف موجود در پایگاه NCBI نشان داد که بز نجدی جز گروه هاپلوتیپی A می باشد. مقایسه توالی ناحیه HVR1 با توالی‎های موجود در بانک ژن می‎تواند به اطلاعات ما درباره نژادهای بز نجدی کمک کند و زمینه را برای استفاده بهتر از آن‎ها در برنامه‎های اصلاحی باز کند. بر اساس نتایج بدست آمده تنوع ژنتیکی بز نجدی در طی سال‎های متمادی افزایش یافته است، که این افزایش تنوع ژنتیکی می‎تواند به دلیل آمیخته‎گری این نژاد با نژادهای دیگر باشد که می‎تواند در آینده منجر به انقراض بز نجدی گردد، که نیازمند توجه بیشتر به این موضوع می‎باشد.

کلیدواژه‌ها

ژنوم میتوکندری؛ ناحیه HVR1؛ تعیین توالی؛ فیلوژنی؛ بز نجدی

مراجع