تایپینگ مولکولی سویه های اسینتوباکتر بامانی جدا شده از عفونت های خون با روش ترادف یابی چند جایگاهی (MLST)

فصلنامه علمی پژوهشی دنیای میکروب ها

مقاله 1، دوره 10، شماره 2 (پیاپی 31)، شهریور 1396، صفحه 104-113   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

زهره محمدی¹؛ حسن ممتاز^{* 2}

¹کارشناس ارشد، گروه میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد

²استاد، گروه میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد

چکیده

سابقه و هدف: اسینتوباکتر بامانی یک کوکوباسیل گرم منفی است که در طبیعت انتشار وسیعی داشته و به عنوان یکی از عوامل مهم عفونت های بیمارستانی محسوب می ­شود. مطالعه حاضر با هدف تعیین الگوی ژنتیکی جدایه های اسینتوباکتر بامانی جدا شده از عفونت های خون به روش تایپینگ ترادف یابی چند جایگاهی (MLST) انجام شد.

مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی، تعداد 36 جدایه اسینتوباکتر بامانی از عفونت های خونی بیماران بیمارستان های پیامبران و بقیه اله (عج) در تهران جداسازی شدند. سپس محصول PCR مربوط به تکثیر 7 ژن خانه دار توالی یابی گردید. توالی­های نوکلئوتیدی تعیین شده از هر ژن در هر جدایه در بانک اطلاعاتی MLST  آنالیز و علاوه بر تعیین آلل های هر ژن، کلون­ های مربوط به تمامی جدایه ها تعیین گردید.
یافته ها: در مجموع 5 کلون ST25، ST136، ST307، ST327 و ST328  در 36 جدایه شناخته شد. ST مربوط به دو جدایه با اطلاعات مربوط در سایت MLST شناسایی نگردید. ST های تعیین شده در 5 خوشه ژنتیکی A تا E قرار گرفتند.

نتیجه گیری: شناسایی میزان قابل قبولی از توع ژ«تیکی در بین جدایه ها با استفاده از تکنیک MLST نشان می دهد که این روش در مطالعه و تایپینگ جدایه های اسینتوباکتر بامانی روش مفیدی به حساب می آید. بنابراین، می توان جدایه های با منشاء متفاوت را در گروه های مختلف تقسیم بندی نمود.

کلیدواژه‌ها

اسینتوباکتر بامانی؛ ژن های خانه دار؛ تایپینگ ترادف یابی چند جایگاهی؛ کلون های ژنتیکی؛ عفونت خون

مراجع