بررسی بیان RNAهای بلند غیرکدکننده‌ی CCAT1، CCHE1، ANRIL، BANCR و PICART1 در سرطان ریه

فصلنامه زیست شناسی جانوری

دوره 14، شماره 1، آذر 1400، صفحه 153-165   

نوع مقاله: مقالات پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/ascij.2021.684785

نویسندگان

ناهید شفقت¹؛ سوده غفوری فرد^{* 2}؛ فتاح ستوده نژاد نعمت الهی¹

¹گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

²گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران

چکیده

سرطان ریه شایع‌ترین بدخیمی با بالاترین میزان مرگ و میر در سراسر جهان است. RNAهای بلند غیر کد‌‌‌کننده (LncRNAs) نقش‌های پیچیده‌ای در شروع و پیشرفت سرطان ریه دارند و در نتیجه بر پیش‌آگهی بیماران تأثیر می‌گذارند. در پژوهش حاضر تغییرات بیان lncRNAهایCCAT1 ،CCHE1 ،ANRIL ، BANCR و PICART1 در بافت‌های توموری در مقایسه با بافت‌های طبیعی مجاور تومور بررسی شدند و پتانسیل آن‌ها به عنوان نشانگر‌های زیستی برای تشخیص و پیش‌آگهی سرطان ریه ارزیابی گردید. به منظور انجام این مطالعه مورد - شاهدی، ۳۰ نمونه‌ی بافت سرطانی ریه و ۳۰ نمونه‌ی بافت غیر سرطانی مجاور تومور جمع‌آوری گردید و پس از استخراج RNA تام و سنتز cDNA، سطح بیان lncRNAهای هدف و ژن مرجع β2M با استفاده از روش Real-time PCR SYBR Green اندازه گیری شد. آنالیز آماری داده‌های Real-time PCR، بین میزان بیان این lncRNAها در  بافت توموری و بافت نرمال اطراف تومور، تفاوت معنی داری نشان ندادند (05/0 ˃ p). همچنین ارتباط معنی داری بین سطح بیان این lncRNAها با هیچ یک از ویژگی‌های جمعیت‌شناختی و پاتولوژیک بیماران مشاهده نشد (05/0 ˃ p). بر اساس یافته‌های این مطالعه می‌توان چنین نتیجه گرفت که این lncRNAها نقشی در سرطان ریه، در بیماران ایرانی ندارند. با این حال برای تأیید نتایج این پژوهش، بررسی بیان این lncRNA ها در تعداد بیشتری نمونه لازم می‌باشد.   

کلیدواژه‌ها

سرطان ریه؛ RNA غیر کد‌کننده بلند؛ CCAT1؛ CCHE1؛ ANRIL؛ BANCR؛ PICART1

مراجع

1. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I., Siegel R. L., Torre L. A., Jemal A. 2018. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA: A Cancer Journal for Clinicians, 68(6): 394–424.
2. Cech T. R., Steitz J. A. 2014. The noncoding RNA revolution - Trashing old rules to forge new ones. Cell, 157(1): 77-94.
3. Chen J., Zhang K., Song H., Wang R., Chu X., & Chen, L. 2016. Long noncoding RNA CCAT1 acts as an oncogene and promotes chemoresistance in docetaxel-resistant lung adenocarcinoma cells. Oncotarget, 7(38): 62474–62489.
4. Hu B., Zhang H., Wang Z., Zhang F., Wei H., Li L. 2017. LncRNA CCAT1/miR-130a-3p axis increases cisplatin resistance in non-small-cell lung cancer cell line by targeting SOX4. Cancer Biology and Therapy, 18(12): 974–983.
5. Huarte M. 2015. The emerging role of lncRNAs in cancer. Nature Medicine, 21(11): 1253-1261.
6. Inamura K. 2017. Lung cancer: understanding its molecular pathology and the 2015 wHO classification. Frontiers in Oncology, 7: 193.
7. Li N., Hao W., Yang J., Guo Y., Guo Y., Du Y. 2020. Long non-coding RNA colon cancer-associated transcript-1 regulates tumor cell proliferation and invasion of non-small-cell lung cancer through suppressing miR-152. Geriatrics and Gerontology International, 20(6): 629–636.
8. Li Y., Yang Z., Wan X., Zhou J., Zhang Y., Ma H., Bai Y. 2016. Clinical prognostic value of metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 in various human cancers: An updated meta-analysis. International Journal of Biological Markers, 31(2): e173–e182.
9. Liao Y., Cheng S., Xiang J., Luo C. 2018. lncRNA CCHE1 increased proliferation, metastasis and invasion of non-small lung cancer cells and predicted poor survival in non-small lung cancer patients. European Review for Medical and Pharmacological Sciences, 22(6): 1686–1692.
10. Lin C., & Yang L. 2018. Long Noncoding RNA in Cancer: Wiring Signaling Circuitry. Trends in Cell Biology, 28(4): 287-301.
11. Lin H., Cheng W., Yan H., Zhang, X. 2018. Overexpression of the long noncoding rna ccat1 promotes metastasis via epithelial-to-mesenchymal transition in lung adenocarcinoma. Oncology Letters, 16(2): 1809–1814.
12. Lin L., Gu Z. T., Chen W. H., Cao, K. J. 2015. Increased expression of the long non-coding RNA ANRIL promotes lung cancer cell metastasis and correlates with poor prognosis. Diagnostic Pathology, 10(1): 14.
13. Lu Y., Zhou X. H., Xu L., Rong C. H., Shen C., Bian W. 2016. Long noncoding RNA ANRIL could be transactivated by c-Myc and promote tumor progression of non-small-cell lung cancer. OncoTargets and Therapy, 9: 3077–3084.
14. Naemura M., Murasaki C., Inoue Y., Okamoto H., Kotake Y. 2015. Long noncoding RNA ANRIL regulates proliferation of non-small cell lung cancer and cervical cancer cells. Anticancer Research, 35(10): 5377–5382.
15. Nakagawa T., Endo H., Yokoyama M., Abe J., Tamai K., Tanaka N., Sato I., Takahashi S., Kondo T., Satoh K. 2013. Large noncoding RNA HOTAIR enhances aggressive biological behavior and is associated with short disease-free survival in human non-small cell lung cancer. Biochemical and Biophysical Research Communications, 436(2): 319–324.
16. Nie F. Q., Sun M., Yang J. S., Xie M., Xu T. P., Xia R., Liu Y. W., Liu X. H., Zhang E. B., Lu K. H., Shu Y. Q. 2015. Long noncoding RNA ANRIL promotes non-small cell lung cancer cell proliferation and inhibits apoptosis by silencing KLF2 and P21 expression. Molecular Cancer Therapeutics, 14(1): 268–277.
17. Sun M., Liu X. H., Wang K. M., Nie F. qi, Kong R., Yang J. song, Xia R., Xu T. P., Jin F. Y., Liu Z. J., Chen J. fei, Zhang E. B., De W., Wang Z. X. 2014. Downregulation of BRAF activated non-coding RNA is associated with poor prognosis for non-small cell lung cancer and promotes metastasis by affecting epithelial-mesenchymal transition. Molecular Cancer, 13(1): 68.
18. Walters S., Maringe C., Coleman M. P., Peake M. D., Butler J., Young N., Bergström S., Hanna L., Jakobsen E., Kölbeck K., Sundstrøm S., Engholm G., Gavin A., Gjerstorff M. L., Hatcher J., Johannesen T. B., Linklater K. M., McGahan C. E., Steward J., Tracey E., Turner D., Richards M.A., Rachet B. 2013. Lung cancer survival and stage at diagnosis in Australia, Canada, Denmark, Norway, Sweden and the UK: A population-based study, 2004-2007. Thorax, 68(6): 551–564.
19. Wei M. M., Zhou G. B. 2016. Long Non-coding RNAs and Their Roles in Non-small-cell Lung Cancer. Genomics, Proteomics and Bioinformatics, 14(5): 280-288.
20. Wei M. M., Zhou Y. C., Wen Z. S., Zhou B., Huang Y. C., Wang G. Z., Zhao X. C., Pan H. L., Qu L. W., Zhang J., Zhang C., Cheng X., Zhou G. B. 2016. Long non-coding RNA stabilizes the Y-box-binding protein 1 and regulates the epidermal growth factor receptor to promote lung carcinogenesis. Oncotarget, 7(37): 59556–59571.
21. Yang J., Lin J., Liu T., Chen T., Pan S., Huang W., Li S. 2014. Analysis of lncRNA expression profiles in non-small cell lung cancers (NSCLC) and their clinical subtypes. Lung Cancer.85(2): 110-115
22. Yang L., Liu G. 2019. lncRNA BANCR suppresses cell viability and invasion and promotes apoptosis in non-small-cell lung cancer cells in vitro and in vivo. Cancer Management and Research, 11: 3565–3574.
23. Yu X., Zheng H., Chan M. T., Wu W. K. K. 2017. BANCR: a cancer-related long non-coding RNA. American Journal of Cancer Research, 7(9): 1779–1787.
24. Zhang C., Su C., Song Q., Dong F., Yu S., Huo J. 2018. LncRNA PICART1 suppressed non-small cell lung cancer cells proliferation and invasion by taPotential clinical application of lncRNAs in non-small cell lung cancerrgeting AKT1 signaling pathway. American Journal of Translational Research, 10(12): 4193–4201.
25. Zhao J. M., Cheng W., He X. G., Liu Y. L., Wang F. F., Gao,Y. F. 2018. Long non-coding RNA PICART1 suppresses proliferation and promotes apoptosis in lung cancer cells by inhibiting JAK2/STAT3 signaling. Neoplasma, 65(5): 779–789.
26. Zhao L., Wang L., Wang Y., Ma P. 2020. Long non‑coding RNA CCAT1 enhances human non‑small cell lung cancer growth through downregulation of microRNA‑218. Oncology Reports, 43(4): 1045–1052.