اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات418
تعداد شماره‌ها10,004
تعداد مقالات83,629
تعداد مشاهده مقاله78,547,297
تعداد دریافت فایل اصل مقاله55,625,055
قاسمی, قاسم, مطهری, بابک, صیادی کردآبادی, ربابه, علیزاده, امید. (1402). مطالعات QSAR، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی روی بازدارنده های اپیژنی. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه آزاد اسلامی, 14(53), 31-38.
قاسم قاسمی; بابک مطهری; ربابه صیادی کردآبادی; امید علیزاده. "مطالعات QSAR، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی روی بازدارنده های اپیژنی". نشریه علمی پژوهشی دانشگاه آزاد اسلامی, 14, 53, 1402, 31-38.
قاسمی, قاسم, مطهری, بابک, صیادی کردآبادی, ربابه, علیزاده, امید. (1402). 'مطالعات QSAR، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی روی بازدارنده های اپیژنی', نشریه علمی پژوهشی دانشگاه آزاد اسلامی, 14(53), pp. 31-38.
قاسمی, قاسم, مطهری, بابک, صیادی کردآبادی, ربابه, علیزاده, امید. مطالعات QSAR، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی روی بازدارنده های اپیژنی. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه آزاد اسلامی, 1402; 14(53): 31-38.

مطالعات QSAR، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی روی بازدارنده های اپیژنی

کاربرد شیمی در محیط زیست
دوره 14، شماره 53، خرداد 1402، صفحه 31-38    اصل مقاله (822.25 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
نویسندگان
قاسم قاسمی* 1؛ بابک مطهری2؛ ربابه صیادی کردآبادی3؛ امید علیزاده3
1دپارتمان شیمی و مهندسی شیمی، شاخه رشت، دانشگاه آزاد اسلامی، رشت، ایران
2دپارتمان مهندسی کامپیوتر شاخه رشت دانشگاه ازاد اسلامی رشت ایران
3دپارتمان شیمی و مهندسی شیمی شاخه رشت دانشگاه ازاد اسلامی رشت ایران
چکیده
توسعه QSAR و داکینگ مولکولی کلید ارزیابی پاتومکانیسم بیماری های اپی ژنی هستند. QSAR، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی روی تعدادی از مدولاتور اصلاح شده کروماتین پروتیینی به عنوان عوامل ضد سرطان انجام شده است. الگوریتم رقابت استعماری، PLS، PCR، MLR و شبیه سازی مونته کارلو در مدل های QSAR استفاده شده است. توصیف کننده های انتخاب شده شامل جرم اتمی ،حجم واندروالس ، شکل و ساختار ژیومتری ترکیبات بودند.سپس بررسی های داکینک مولکولی با برنامه اتوداک وینا با دقت بالا انجام شد. بر اساس تعداد پیوند هیدروژنی، طول پیوند، افینیتی و RMSD بهترین کمپلکس ها انتخاب شدند. بر اساس مطالعات QSAR ,داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی ترکیبات 9 و 14 برای داروهای ضد سرطان پیشنهد می شوند. توصیف کننده های Drug-likeness از ترکیبات با برنامه DruLiTo محاسبه شدند. در مطالعات داکینگ بالاترین افینیتی 9 کیلوکالری بر مول بود که بین سیستم آنزیمی PDB: 3MXF و مولکول های بهینه شده بوده که نشان از برهمکنش قوی دارد.
کلیدواژه‌ها
QSAR پروتین های کروماتین اصلاح شده؛ الگوریتم رقابت استعماری؛ داکینگ مولکولی؛ شبیه سازی دینامیک مولکولی
مراجع
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 86
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 180


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب