بررسی روش های مختلف برای شناسایی ژنوتیپ های گونه های جنس Armillaris (قارچ عسلی)

زیست شناسی تکوینی

مقاله 9، دوره 16، شماره 1 - شماره پیاپی 61، بهمن 1402

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.30495/jdb.2023.1975728.1347

نویسنده

سپیده قهاری^*

گروه زیست شناسی، دانشکده علوم زیستی،دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، تهران، ایران

چکیده

هدف از مطالعه اخیر مقایسه SI با استفاده از سه روش دیگر برای تمایز ژنوتیپ ها است که عبارتند از: روش چند شکلی قطعات DNA حاصل از تکثیر تصادفی (RAPD)، بررسی الل های تیپ-آمیزشی و آنالیز ایزوآنزیم ها RAPD و الل های تیپ-آمیزشی در 73 ایزوله، که متعلق به 36 ژنوتیپ شناسایی شده بر اساس آنالیز بودند، مورد استفاده قرار گرفتند. بررسی تعداد محدودی از ایزوله ها با استفاده از پلی مورفیسم ایزوآنزیم انجام شد. RAPDs، الل های تیپ آمیزشی و SI در هر سه مورد ایزوله های تمایز یافته از طریق واکنش های SI شامل دو زیرگروه با فنوتیپ های RAPD متفاوت بودند. در دو مورد گروه های تمایز یافته از طریق واکنش های SI مجموعه مشابهی از الل های تیپ آمیزشی را به اشتراک گذاشتند. آنالیز ایزوآنزیم نشان دهنده تفاوت های بین گونه ای و تفاوت های ناچیز بین ژنوتیپ های یک گونه یکسان بود. این یافته ها باعث شده تا استفاده از SI به عنوان روشی روتین و معتبر برای مطالعات اپیدمیولوژیک گونه های Armillaria در نظر گرفته شود.
در گروه یکسانی از ایزوله ها، پروفایل های قطعه EcoR I مربوط به DNA میتوکندری نیز بررسی شدند. این آنالیز ژنوتیپ ها را مجددا در ’تیپ های میتوکندریایی‘ گروه بندی کرد که سیتوپلاسم معمولی را به اشتراک گذاشته و احتمالا از طریق تولید مثل جنسی ارتباط نزدیکی با یکدیگر دارند.

کلیدواژه‌ها

گونه های جنس Armillaris؛ RAPD؛ RFLP؛ الل های تیپ-آمیزشی

مراجع