دسته‌بندی ژنتیکی ایزوله‌های اشریشیاکلی O157:H7جدا شده از گوشت خام دام و طیور با روش RAPD-PCR

میکروب شناسی مواد غذائی- Journal of Food Microbiology

مقاله 6، دوره 7، شماره 4، دی 1399، صفحه 47-58   

نوع مقاله: اصیل پژوهشی

نویسندگان

ماندانا لطفی¹؛ حسن ممتاز^{* 2}؛ الهه تاج بخش³

¹دانش آموخته دکترای میکروبیولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران

²استاد میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران

³دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد

چکیده

باکتری اشریشیاکلی O157:H7یکی از مهم­ترین سویه­های بیماری­زای روده­ای است که معمولا از طریق آب و غذای آلوده به انسان منتقل می­شود. این سویه عامل ایجاد کولیت خونریزی­دهنده، سندرم HUS، ترومبوتیک سیتوپنیک پورپورا و در مواردی مرگ است. مخزن اصلی این باکتری نشخوارکنندگان هستند. هدف از این پژوهش دسته­بندی ژنتیکی (ژنوتایپینگ) ایزوله­های این سویه جدا شده از گوشت خام دام و طیور با روش RAPD-PCR است. 344 نمونه گوشت خام نشخوارکنندگان و طیور از مراکز عرضه گوشت تازه در شهرهای اصفهان و شهرکرد جمع­آوری و پس از کشت و جداسازی اشریشیاکلی از آن ها، حضور سروتیپ O157:H7با استفاده از روش­ PCR تایید شد. جهت دسته بندی ژنتیکی ایزوله های O157:H7 جدا شده از روش  RAPD-PCR استفاده شد. از مجموع 344 نمونه گوشت خام مورد مطالعه، 202 جدایه اشریشیاکلی (7/58درصد) جداسازی شد که میزان آلودگی به سویه O157:H7 در آن ها، 8/17 درصد (36 نمونه) بود.دسته بندی ژنتیکی جدایه­های اشریشیاکلی O157:H7، 9 پروفایل مختلف را در میان این 36 جدایه نشان داد و قرابتی معادل 7/43 تا 100 درصد در بین ایزوله ها یافت شد. در این پژوهش تشابه مولکولی زیادی بین سویه‌هایاشریشیاکلی O157:H7جدا شده از گوشت حیوانات مختلف در شهرهای اصفهان و شهرکرد دیده شد. همچنین مشخص شد که روش RAPD-PCR روشی ساده، سریع و ارزان جهت توصیف تنوع ژنتیکی سویه­های مختلف اشریشیاکلی ازجمله سویه ­O157:H7می­باشد

کلیدواژه‌ها

اشریشیاکلی O157:H7؛ RAPD-PCR؛ دسته بندی ژنتیکی؛ گوشت خام

مراجع